黑暗圣经动画片这部成长题材的圣经史诗通过玛利亚的视角，讲述了历史上最具影响力的人物之一，以及她在耶稣诞生前的非凡经历。玛利亚（诺娅·科恩 饰）被选中将救世主带入人间，然而在奇迹般的受孕后，她遭到排斥并被迫躲藏。当希律王（安东尼·霍普金斯 饰）下令搜捕她刚出生的婴儿后，玛利亚和若瑟（伊多·塔可 饰）为了挽救孩子的生命，踏上逃亡之路，在信仰的约束和勇气的驱使下，不惜一切代价拯救孩子。